别看左良玉起兵东进，但紧张的只是朱由崧和马士英、阮大铖等人，东林党到还真不怎么害怕，因为劝左良玉起兵的黄澍就是东林一员，而且左良玉在檄文中也把矛头指向马士英，而不是东林党，另外左良玉的大恩人，另一位东林的元老候恂这时也在南京，因此就算左良玉真的打进南京，也不会把东林党怎么样。相反还可以借左良玉的力量，来铲除掉马士英。甚致还有人主张，干脆说动商毅，直接动手把马士英干掉就行了。刘宗周、黄宗羲也扭不过众人，只好来见商毅。
三人见面之后，先客气了一番，黄宗羲道：“此番商军门又在淮安大败清虏，我们也十分欣慰，如今大明只剩这半壁江山，此后抵御清虏，也多倚仗商军门了。”
商毅道：“南雷先生太客气了，这些都是在下份内之事，如今清虏大军压境，但以在下一己之力，要保住这半壁江山，又谈何容易，只有大明君臣精诚团结，齐心协力，筹边制寇方才可成，如果各怀异志，不顾大局，则天下危矣。”
黄宗羲和刘宗周互相看了一眼，黄宗羲道：“商军门可知，如今我大明之祸，并不在外，而在于內。因此筹边制寇，乃在亲君子远小人而已。”
商毅摇了摇头，道：“南雷先生，如令偏安尚未稳。孜孜讨究，应该只有兵饷战守四字，岂能为异同恩怨四字，岂不闻兄弟厥于墙，而外御其侮吗？可况在下素闻大君子以其能化小人为君子，今日国事为重，以君民为心，则和一之至，不必合党同群，而自无不同。以职掌为务，则猷念各分，不必破党涣群，而自无不异。”
商毅的古文功底其实很一般，这一大通之乎者也的话，其实都是王夫之教他的，总算没有记漏，但刘宗周却拂然不悦，道：“难到商军门不知，襄外必先安内吗？”
商毅也不客气，道：“请问念台先生，如果清军打过长江，攻破南京，又到那里去谈安内呢？”
三个人没说几句，立刻就说僵了，互相间都不说话。
商毅本来还想尽最大的努力，尽量让刘宗周和黄宗羲以大局为念，现在看来，根本就无法做到，因此也不想和他们多费口舌，道：“二位先生，我商毅只是一介武人，大道理不懂，这次护送公主进京指认太孑真假，一定会秉公而认，真就是真，假就是假，使真像大白于天下，以安民心。然后立刻离开南京，赴江北抵御清虏，尽人臣之职，其余之事，一概不论。”
刘宗周和黄宗羲听了，也知道自己是不可能说服商毅了，因此起身告辞，连头也不回就走了。
商毅也只好苦笑了几声，看来自己和东林党确实没法谈到一起来，正要回去告诉朱媺娖，这时又有人来报，吴甡来访。商毅摇了摇头，只好又让随从人员去请。
两人见礼之后，吴甡叹了一口气，道：“以恒，现在南京已经够乱了，你又跑来凑什么热闹。”
商毅也苦笑道：“阁老应该知道，这些乱子其实有一大半都是你们东林党闹出来的，我本也不想来凑这个热闹，只是事情逼到这一步了，不来也不行了，阁老既然是东林的元老，为什么不管管他们，也做些对国家、对朝廷有用的事情。那怕是不过什么事情，就是消停一些，也好过这样乱闹下去。”因为商毅和吴甡的关系不同，因此说话也就不用客套，直接得多了。
其实在吴甡心里，对一些东林党这样闹法非常不满，他才是真正有见识，有能力的人，而且也知道变通，当然清楚当前的局式，应该以团结一心，一致对外，才能保住半壁江山。只是吴甡的官职虽高，但在东林党里并没有多少发言权，也管不住其他人，也不好强制，只能听之任之，现在被商毅一说，吴甡也听得脸红一阵白一阵，但他也清楚，商毅说的确实都是事实，一句话也反驳不了，只好苦笑了一声，道：“事情弄到今天这一步，我也沒有办法。”
商毅这才放缓了语气，道：“我也知道阁老的为难之处，只是如果任甴他们这样胡乱闹下去，我只怕阁老总有一天会被他们连累。”
吴甡心中一禀，道：“你这是什么意思。”
商毅并没有正面回答，道：“我这次进京，想了一个万全之策。”说着把自己的计划说了一遍。