“谢皇上不杀之恩！”
众人听了朱由检的话，皆松了一口气，没人敢质疑皇帝不敢杀他们，这个皇帝绝对做得出来。
“死罪可免，活罪难逃，”朱由检冷淡的道“朕给你等一个机会，从今以后，专心给朕领兵，和那些乱七八糟的商贾断绝来往，不得做那些偷鸡摸狗之事。”
“记住，”朱由检冷声道“你等都是朕的臣子，都是大明的将军，不是那些个偷奸耍滑，投机取巧的惫赖。”
“只要忠于朕，朕保你等一生荣华富贵，保你等后世子孙与大明共存！”
“誓死效忠皇上！”
“南居益，”大骂一阵后，朱由检开始说正事。
“臣在，”南居益急忙上前听后吩咐。
朱由检略微迟疑后道“朕在兵部之下划一衙门，名曰大明海军衙门，统管大明水军，海军衙门虽属兵部，但直接对朕负责，朕封你为海军衙门主事官员，正三品！”
“臣遵旨！”
南居益听后大喜，他本以为再干几年的郎中，混个侍郎，然后告老还乡享清福，没想到皇帝竟然启用他，而且一来就给他如此大的重任，南居益突然有种老骥伏枥的雄心壮志。
“撤销巢湖水师和各地水师卫所，在长江沿线设立长江水师，负责内地胡泊巡航和剿匪，至于内地，视情况建立相应的内地水师，，，，，，”
“想来你等都听说了，”朱由检淡然道“纵横大明海域的郑一官率众投效朝廷，朕已经封其为南海海军参将，负责南边海域安全！”
“南边有了郑一官，朕很放心，所以，朕欲令南边给水师卫所兵马全部北上，东边沿海一带，组建东海海军舰队，东海海军舰队由南边个水师卫所、巢湖水师、宁波水师等重建而成。”
说了大半天话，朱由检感觉口干舌燥，细心的王承恩急忙地上温茶。
朱由检大大的喝了口茶后，这次开口道“同时，北方海域，朕欲调集天津卫、登州卫、威海卫、金州卫、灵州卫等水师，组建北海海军舰队。”
“如此一来，”朱由检自信满满的道“大明内河，由各地水师负责巡航，沿海，则组建海防军负责封锁，缉拿走私，海外，则由北海舰队、东海舰队、南海舰队负责镇守。”